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アプリケーションの説明

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PedScope は絶滅危惧種の保全と安全な飼育慣行血統書付きの家畜、猫、犬などの閉鎖または小規模の集団内での捕獲下繁殖プログラム内のアプリケーションとの高度な血統分析ソフトウェアです。含む様々 な血統メトリックを計算します: ライトの係数近親交配;先祖の近交係数;創設者の同等、創設者のゲノムの同等、効果的な祖先; 数などの遺伝的多様性の各種メジャー意味 kinships と親族値;世代番号;#generations を見て、フル #generations、#unique の祖先を含む家系メトリック;。#offspring、#sibs などの関係をカウントします;。年齢関連のメトリクスが世代別年齢、死亡時の年齢、年齢の最初の子、等を含みます。それは個人のユーザーが指定したグループの創始者の詳細な分析を実行して各創設者、各創設者のゲノムの一意性、各創設者遺伝子まだ現在の人口の割合と、グループの影響力のある祖先のための遺伝子の割合を報告できます。最大 20,000, 000 の個人と血統書付きのコープス。

使用 PedScope 例えば繁殖の決定を導くための嵌合の推奨設定を生成する継続的な人口内の将来の遺伝的多様性を最大化または最小化する近親交配に。それはまた個人のグループの統計情報を報告、例えば平均近親交配、または子孫、または中央の長寿の最大数。これらは各日付期間例えば誕生年の計算することができます。祖先と子孫は、いずれかの単一の個人または個人のグループをカバーするためなどの関係の詳細なレポートを生成します。親レポートは、#occurrences を含めることができます最小\/最大の世代を見て、% の血液パス長が共通の祖先、部分の近交係数と各祖先、創設者の先祖の名前を親族係数創設の祖先のため。
PedScope is software for advanced pedigree analysis, with applications in captive breeding programmes for endangered species conservation and safe breeding practices within closed or small populations such as pedigreed livestock, cats, dogs, etc. It computes various pedigree metrics including: Wright's coefficient of inbreeding; ancestral inbreeding coefficients; various measures of genetic diversity including founder equivalents, founder genome equivalents, and the effective number of ancestors; mean kinships and kinship values; generation numbers; ancestry metrics including #generations seen, #generations full, #unique ancestors, etc.; relation counts such as #offspring, #sibs, etc.; age-related metrics including generational age, age at death, age at first child, etc. It can perform detailed founder analyses for user-specified groups of individuals and report the proportion of genes present due to each founder, the genome uniqueness of each founder, the percentage of each founders genes still present in the current population, and the influential ancestors of the group. Copes with pedigrees with up to 20,000,000 individuals.

Use PedScope to generate mating recommendations for guiding breeding decisions e.g. to maximize future genetic diversity within the ongoing population or minimize inbreeding. It will also report statistics for groups of individuals, e.g. average inbreeding, or the maximum number of offspring, or the median longevity. These can be computed for each date period e.g. birth year. It generates detailed relations reports, such as ancestors and descendants, either for a single individual, or covering a group of individuals. Ancestor reports can include #occurrences, min/max generation seen, %blood, path length to common ancestors, kinship coefficients to each ancestor, names of founder ancestors, and partial inbreeding coefficients for founder ancestors.

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販売業者: Tenset Technologies リリース: 2014/04/11
バージョン: 2.3.01 対応言語: 英語
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